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苹果手机短信保存在手机中的信息应用里，可以通过以下步骤设置密码保护。
1、打开“设置”应用，滚动并找到“信息”选项，点击进入。
2、在“信息”设置中，找到并点击“密码锁定”选项。
3、如果第一次进入此设置，需要为短信应用设置一个密码或指纹锁，为了安全起见，建议设置一个复杂的密码或使用指纹锁。
4、设置完成后，返回信息应用并启用密码保护，当退出信息应用或长时间未使用时，下次进入短信应用时需要输入密码才能访问。
不同版本的iOS系统设置可能存在差异，建议根据自己的手机版本查找相应的设置选项，为了安全起见，请确保定期备份手机数据以防万一。